NVIDIA 日前表示,上海交通大学魏冬青教授的团队使用了 5 台 NVIDIA 研发的 DGX-2 AI 超算超算用于寻找抗病毒药物,筛选效率从之前的 2 个月提升到 2 天,而且发论文的数量也是之前的十多倍。
在对抗新冠病毒的过程中,寻找有效治疗药物是关键,现代药物研发就需要超强的计算能力了, AI 人工智能也是必不可少的。
魏冬青教授带领研究团队选择利用人工智能技术进行分子动力学模拟,在现有小分子药物(包括 FDA 已批准的药物)中筛选能够对新冠病毒起到抑制性作用的药物,以实现老药新用,进而可以马上进行临床应用。
据魏教授介绍,在药物筛选过程中,研究团队需要对几十万种分子进行分子动力学模拟计算,面对如此大规模的计算量,如按照目前常规的算力条件,团队需要1到2个月的时间才能完成全部模拟。
但是疫情面前,时间就是生命。最终魏教授的团队选择了 5 台 NVIDIA 的 DGX-2 人工智能超算用于此次的研究。
NVIDIA 表示, DGX-2 人工智能超级计算机是 NVIDIA GPU 计算和存储能力的集大成者,其配置了 16 张 NVIDIA Tesla V100 GPU , 可扩展架构使得模型的复杂性和应用的规模不受传统架构局限性的限制,由多台 DGX-2 组成的 GPU 集群更是可以轻松应对数据科学各种复杂的 AI 和 HPC 挑战。
NVIDIA 表示,有了超高性能的计算资源助力,再配合先进的医学研究深度学习软件, 团队的药物研究进程得到了极大地提速,原本需要 1 到 2 个月才能完成的模拟计算,如今只用 1 到 2 天就完成了 。
不仅工作效率大幅提升, NVIDIA 还强调发表科研成果的速度变了,过去魏教授每三年发表的论文也就是 4-5 篇,最多不超过 10 篇。
借助于 AI 技术的广泛应用, 现在魏教授带领团队在 3 年的时间里发表了 90 余篇论文成果,科研进程相比于过去有了极大的提速 。
详细情况可以参考 NVIDIA 官方发表的博文—— 超强 DGX-2 加速抗新冠病毒药物研究,助力打赢抗 “ 疫 ”战
【作者:宪瑞】
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